含氟产品在农药领域中也广泛的应用。在过去20年开发的农药产品中，含氟农药占到51.9%，尤其杀虫剂占80%。由于含氟化合物高效，低度，低残留的特性，将继续是未来绿色农药发展的一个主要方向。永太科技的农药中间体广泛应用于多种除草剂、杀菌剂，并为全球多家农药巨头提供千吨级定制加工服务。
同时，公司通过收购上海浓辉，初步建立了遍及全球60余个国家的农药中间体、原药销售渠道，在海外提交近1800项农药产品的登记资料，其中获颁农药登记证书500余项，已成为拥有海外农药登记证书最多的国内植保产品出口商之一。